I 1991 åbnede Ole Kristoffersen i København det første bageri i stueetagen på Torvegade ved Christianshavns Torv, en bygning hvis skiftende etagefarver inspirerede til bageriets navn, Lagekagehuset. Herefter åbner Ole Kristoffersen flere bagerier i København.

I 2008 starter Ole Kristoffersen samarbejde Steen Skallebæk, der selv ejede en række jyske bagerier under navnet Skallebæk Bageri og herefter samarbejder de som en landsdækkende kæde.

2017 blev Lagkagehuset solgt til kapitalfonden Nordic Capital.